fa رویکردی جدید جهت شناسایی و تعیین ارتباط جهش‌های ژنی mecA بر مبنای HRM با نوع نمونه بالینی در ایزوله‌های استافیلوکوک اورئوس علوم پایه Basic Sciences پژوهشي اصیل Original Atricle <div style="text-align: justify;"><strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">زمینه و هدف</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;">: جهش ژنی در استافیلوکوک اورئوس از مهم</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">ترین دلایل ایجاد سویه‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک است. روش آنالیز منحنی ذوب</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"> DNA </span></span><span style="font-family:b nazanin;">با قدرت تفکیک بالا</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">(HRM) </span></span><span style="font-family:b nazanin;">می‌تواند این جهش‌ها را با کیفیت بسیار بالایی شناسایی کند. هدف از این مطالعه، ارزیابی نقش نوع نمونه بالینی در بروز جهش‌های نوکلئوتیدی در ژن‌</span> <em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">mecA</span></span></em> <span style="font-family:b nazanin;">استافیلوکوک اورئوس به روش</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"> HRM </span></span><span style="font-family:b nazanin;">بود</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">.</span></span><br> <strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">مواد و روش‌ها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"> در این مطالعه تجربی، از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس استفاده شد. جهت شناسایی جهش‌های احتمالی، ایزوله‌های دارای ژن</span> <em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">mecA</span></span></em> <span style="font-family:b nazanin;">شناسایی و ژن مربوطه تعیین توالی شد. سپس،</span> <span style="font-family:b nazanin;">تجزیه و تحلیل داده</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">ها با استفاده از نرم</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">افزارهای‌</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"> StepOne v2.3 </span></span><span style="font-family:b nazanin;">و‌</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">HRM v3.0.1</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> انجام شد. نتایج تعیین توالی به عنوان استاندارد طلایی مورد استفاده قرار گرفت</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">.</span></span><br> <strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">ملاحظات اخلاقی:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;">این مطالعه با کد اخلاق </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">IR.UMSHA.REC.1396.637</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> در کمیته اخلاق پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی همدان به تصویب رسیده است.</span><br> <strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">یافته‌ها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"> از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس، 11 ایزوله (58/25 درصد) دارای ژن</span> <em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">mecA</span></span></em> <span style="font-family:b nazanin;">و 32 ایزوله (41/47 درصد) فاقد ژن</span> <em><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">mecA</span></span></em> <span style="font-family:b nazanin;">بودند. با توجه به نمونه‌های بالینی مختلف، 3 ایزوله (27/27 درصد) مقاوم به متی‌سیلین از نمونه خون، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه ادرار، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه زخم، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه کاتاتر، 1 ایزوله (09/9 درصد) از آبسه و 1 ایزوله (09/9 درصد) هم از سواپ بینی جدا شد. در این بین، ایزوله‌های گرفته شده از زخم و ادرار دارای بیشترین جهش در اسید‌آمینه آدنین به</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">صورت </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">A&rarr;T</span></span><span style="font-family:b nazanin;">، </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">A&rarr;G</span></span><span style="font-family:b nazanin;">، </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">A&rarr;C </span></span><span style="font-family:b nazanin;">&nbsp;و</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"> A&rarr;X </span></span><span style="font-family:b nazanin;">مشاهده شد. ایزوله‌های جدا شده از خون داری جهش در اسید آمینه گوانین به</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">صورت</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"> G&rarr;A </span></span><span style="font-family:b nazanin;">بودند.</span><br> <strong><span dir="RTL"><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;">نتیجه‌گیری:</span></span></span></span></strong><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;"> ارتباط معنی</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:11.0pt;">‌</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;">داری بین نوع جهش و نوع نمونه بالینی در ایزوله</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:11.0pt;">‌</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:11.0pt;">های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین دیده شد.</span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-family:times new roman;"><strong>Background and Aim:</strong> Gene mutation in <em>Staphylococcus aureus</em> is one of the most important causes of antibiotic-resistant strains. The High Resolution Melting Curve (HRM) analysis of DNA method can detect these mutations very high quality. The purpose of this study was to evaluate the role of clinical sample type in the occurrence of nucleotide mutations in the mecA gene of <em>S. aureus</em> by HRM method.<br> <strong>Materials and Methods:</strong> In this experimental study, 43 clinical isolates of S. aureus were used. To detect possible mutations, isolates with <em>mecA </em>gene were replicated and sequenced. Then, analysis was performed using StepOne Software v2.3 and HRM v3.0.1 software. Sequencing results were used as gold-standard.<br> <strong>Ethical Considerations:</strong> This study with research ethics code IR.UMSHA.REC.1396.637 has been approved by research ethics committee at Hamadan University of Medical Sciences.<br> <strong>Findings:</strong> Of 43 clinical isolates of S. aureus, 11 isolates (25.58%) had <em>mecA </em>gene and 32 isolates (47.41%) lacked the <em>mecA</em> gene. According to different clinical samples, 3 isolates (27.27%) were resistant to methicillin from blood samples, 2 isolates (18.18%) from urine specimens, 2 isolates (18.18%) from wound samples, 2 isolates (18.18%) of the catheter samples, 1 isolate (9.09%) of the abscess and 1 isolate (9.09%) were separated from the nose swab. In the meanwhile, isolates from the wound and urine had the highest mutation in the adenine amino acid as A &rarr; T, A &rarr; G, A &rarr; C, and<br> A &rarr; X. Isolates taken from blood have mutations in Guanine amino acid as<br> G &rarr; A.<br> <strong>Conclusion:</strong> There was a significant relationship between type of mutation and type of clinical specimen in methicillin-resistant <em>Staphylococcus aureus</em> isolates.</span></div> استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین, جهش ژنی, منحنی ذوب DNA ,HRM DNA melting curve, Genetic mutation, HRM , Methicillin resistance staphylococcus aureus 68 79 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2844-7&slc_lang=fa&sid=1 Hamed Tahmasebi حامد طهماسبی h.tahmasebi87@yahoo.com 4600319475328460065938 4600319475328460065938 No Department of Microbiology, School of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran. گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران. Sanaz Dehbashi ساناز ده باشی sanazdehbashi@yahoo.com 4600319475328460065939 4600319475328460065939 No Department of Microbiology, School of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran. گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران. Mohammad Reza Arabestani محمد رضا عربستانی mohammad.arabestani@gmail.com 4600319475328460065940 4600319475328460065940 Yes Department of Microbiology, School of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran. Nutrition Health Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran. گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران. مرکز سلامت تغذیه، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران.