Journal of Arak University of Medical Sciences

fa بررسی ژنوتایپ محل اتصال hsa-miR-433-3P در ناحیه تنظیمی TYMS در نمونه‌های سرطان سینه Gengenotypic Evaluation of Hsa-miR-433-3p Binding Site in the Regulatory Region of TYMS in Breast Cancer Patients عمومى General پژوهشي اصیل Original Atricle <div style="text-align: justify;">چکیده زمینه و هدف: سرطان سینه شایعترین سرطان در زنان سراسر جهان است. ارتباط این بیماری با وقوع تغییرات در ژن های متعدد اثبات شده است. یکی از مسیرهای مرتبط با سرطان سینه مسیر بازجذب فولات است. آنزیم کلیدی این مسیر پیامرسانی توسط ژن TYMS کد می شود. miRNAها با اتصال به نواحی تنظیمی ژن ها بیان آن ها را کنترل میکنند. در این مطالعه، وجود تغییر در ناحیه تنظیمی TYMS در ارتباط با ویژگی های دموگرافیکی (شامل گرید و متاستاز) بیماران سرطان سینه مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: در این مطالعه ابتدا ناحیه تنظیمی ژن TYMS با کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیکی مرتبط، مورد بررسی قرار گرفت. پس از جمع آوری نمونه های سرطانی و استخراج  DNAاز نمونه های خون، تغییر در ناحیه اتصال miRNA مورد مطالعه توسط برش آنزیمی NlaIII بررسی شد. یافته ها: بررسیهای بیوانفورماتیکی نشان داد که محل اثر برخی از آنزیم های محدود کننده در 3'-UTR ژن TYMS مرتبط با ناحیه اتصال miRNAهایی از جمله Hsa-miR-433-3p قرار دارد. نتایج حاکی از صحت فرآیند تخلیص ماده ژنومی، PCR و برش آنزیمی بود. در ناحیه تنظیمی مورد بررسی، ژنوتایپ های هوموزیگوت CC، هتروزیگوت AC و واریانت هوموزیگوت موتانت AA با فراوانی متفاوت نسبت به نمونه های سالم مشاهده شد (05/0 > p ، 4923/2 تا 7275/. : CI 95% ، 3465/1 : OR). همچنین ارتباط ژنوتایپ AA با گرید بالا و متاستاز از نظر آماری تایید شد. نتیجه گیری: در مطالعات متعدد مشخص شده است برخی از پلیمورفیسم ها در ژن های کلیدی مرتبط با سرطان با تشخیص و پروسه درمان آنها ارتباط مستقیم دارد. با توجه به اهمیت تشخیص به موقع در درمان سرطان، دستیابی به بیومارکرهای تشخیصی در سرطان سینه در مراحل اولیه حائز اهمیت خواهد بود. احتمالا تغییر نوکلئوتیدی در سایت اتصال miRNA مورد مطالعه می تواند به عنوان بیومارکر تشخیصی تومور مورد استفاده قرار گیرد. </div> <div style="text-align: justify;">Abstract Background: Breast cancer is the most common cancer in women. It has been proven the association of cause of this disease with changes in several genes. One of the pathways associated with breast cancer is the folate reuptake pathway. The key enzyme of this pathway is coded by the TYMS gene. MicroRNAs control the expression of genes by binding to their regulatory regions. In this study, we evaluated changes in the regulatory region of TYMS gene with demographic characteristics (including the grade of cancer and metastasis) in breast cancer patients. Materials and Methods: In this study, the regulatory region of TYMS gene was investigated using related bioinformatics software. After collecting cancerous samples and DNA extraction from blood samples of normal and patients, change in the miRNA binding region by digestion with NlaIII enzyme was assayed. Results: Bioinformatics studies showed that the restriction site of some of the endonuclease enzymes in the 3'-UTR of the TYMS gene is related to the binding region of miRNAs, including Hsa-miR-433-3p. The results indicated the correctness of the genomic purification process, the PCR and enzymatic digestion reaction. In this study, in the regulatory region, CC homozygote, AC heterozygote and AA mutant homozygote variant had differences with control group (OR: 1.3465, %95 CI: 0.7275 to 2.4923, p<0.05). Also, the association of AA genotypes with metastasis and high grade of the patients was confirmed statistically. Conclusion: Studies have shown that some of polymorphisms in the key genes involved in cancer are directly related to their diagnosis and treatment process, and given the importance of timely diagnosis of cancer, the achievement of diagnostic biomarkers in breast cancer in the early stages will be important. Probably, the nucleotide change at the site of the microRNA binding site could be used as a diagnostic biomarker for degree of tumor progression.</div> سرطان سینه, TYMS, 3'-UTR, بیومارکر Biomarker, Breast Cancer, TYMS, 3'-UTR 1 9 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2868-2&slc_lang=fa&sid=1 Ali Arash Anoushirvani علی آرش انوشیروانی a.aa.arak2017@gmail.com 4600319475328460063603 4600319475328460063603 No Fellowship of Oncology, Ayatollah Khansari Hospital, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. فوق تخصص خون و آنکولوژی، بیمارستان آیت اله خوانساری، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Azam Ahmadi اعظم احمدی azam.ahmadi@modares.ac.ir 4600319475328460063604 4600319475328460063604 Yes Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Reza Aghabozorgi رضا آقابزرگی dr.aghabozorgi@arakmu.ac.ir 4600319475328460063605 4600319475328460063605 No Fellowship of Oncology, Ayatollah Khansari Hospital, School of Medicine, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. فوق تخصص خون و آنکولوژی، بیمارستان آیت اله خوانساری، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Sara Khalili سارا خلیلی sarakhalili89@yahoo.com 4600319475328460063606 4600319475328460063606 No Department of Microbiology, Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. گروه میکروبیولوژی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Maryam Sahraei مریم صحرایی sahraeimaryam@gmail.com 4600319475328460063607 4600319475328460063607 No Department of Genetics, Arak University, Arak, Iran. گروه ژنتیک، دانشگاه اراک، اراک، ایران Taha Fereydouni طه فریدونی t.fereydouni@arakmu.ac.ir 4600319475328460063608 4600319475328460063608 No Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران Zoha Khademi ضحی خادمی z.khademi@arakmu.ac.ir 4600319475328460063609 4600319475328460063609 No Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران