fa مقایسه تشخیص سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با روش Flash PCR و روش مرسوم کشت عفونی Infection پژوهشي اصیل Original Atricle <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">زمینه و هدف</span></span></strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">:</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> رنگ‌آمیزی</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">&shy;</span></span><span style="font-family:b nazanin;">های</span> <span style="font-family:b nazanin;">زیل</span> <span style="font-family:b nazanin;">نلسون،</span> <span style="font-family:b nazanin;">فلوئورسنت</span> <span style="font-family:b nazanin;">و نیز کشت، روش&shy;های</span> <span style="font-family:b nazanin;">استاندارد</span> <span style="font-family:b nazanin;">تشخیص بیماری</span> <span style="font-family:b nazanin;">سل</span> <span style="font-family:b nazanin;">هستند</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">.</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> در این تحقیق، کارائی روش </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Flash PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> با روش مرسوم کشت مقایسه شد.</span><br> <strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">مواد و روش</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span></span></strong><strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">ها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"> تعداد 56 نمونه خلط از بیماران مشکوک به سل پس از ارزیابی با روش زیل نلسون و کشت در لوون اشتاین جانسن، به روش چلکس تحت استخراج </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">DNA</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> قرار گرفتند. جهت بررسی مولکولی از کیت مخصوص </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">Flash PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> که محتوی پروب‌ها و پرایمرها برای تکثیر ژن </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">IS6110</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> بود، استفاده شد. کنترل مثبت و کنترل منفی موجود در کیت به</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">کار گرفته شد و دستگاه </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">MTC410</span></span><span style="font-family:b nazanin;">، جهت تکثیر و دستگاه </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">FD-12</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> جهت بررسی نتایج مورد استفاده قرار گرفتند. علاوه بر این، نمونه‌ها با کمک ژل آگارز نیز الکتروفورز شدند.</span><br> <strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">یافته</span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span></span></strong><strong><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">ها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"> از 56 نمونه خلط بیماران مشکوک به سل، تعداد 20 نمونه در ارزیابی میکروسکوپی و کشت، مثبت و 36 نمونه منفی بودند. هم</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">چنین، بررسی مولکولی با استفاده از روش </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">FLASH-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> مشخص کرد که تمامی 20 نمونه مثبت، در این روش مولکولی نیز مثبت شدند. به</span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span style="font-family:b nazanin;">علاوه،</span> <span style="font-family:b nazanin;">3 نمونه خلط که با روش کشت و رنگ آمیزی منفی شده بودند در روش </span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;">FLASH-PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"> مثبت شدند. یکی از 3 بیمار مورد بحث با نظر پزشک تحت درمان حمله‌ای برای درمان سل با دریافت آنتی بیوتیک&shy;های ایزونیازید، پیرازینامید و اتامبوتول قرار گرفت. تمامی نتایج با کمک الکتروفورز معمول نیز تایید گردیدند.</span><br> <strong><span dir="RTL"><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">نتیجه</span></span></span><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span></span><span dir="RTL"><span style="color:#12336E;"><span style="font-family:b nazanin;">گیری:</span></span></span></strong><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;"> مواردی که احتمالا به دلیل تعداد باکتری اندک در نمونه یا نقص در نمونه</span></span><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;">برداری، منفی می‌شوند، با روش </span></span><span style="font-family:times new roman,serif;">FLASH-PCR</span><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;"> امکان مثبت شدن آن‌ها وجود دارد. بنابراین، با توجه به هزینه اندک، برای استفاده روتین پیشنهاد می</span></span><span style="font-family:times new roman,serif;">‌</span><span dir="RTL"><span style="font-family:b nazanin;">شود.</span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:times new roman;"><strong>Background and Aim</strong>: Ziehl Nelson staining, fluorescent and also culture are the standard methods for the diagnosis of tuberculosis. In this study, the performance of conventional cultivation methods was compared with Flash PCR.<br> <strong>Materials and Methods:</strong> A total of 56 sputum samples from patients with suspected tuberculosis in Tuberculosis Center of Arak city were collected and Ziehl&ndash;Neelsen and culture in L&ouml;wenstein&ndash;Jensen medium were accomplished. Moreover, DNA from all of the 56 sputum samples was extracted by Chelex100 method. Molecular evaluation was accomplished by Flash PCR kit containing probes and primers for gene amplification IS6110. Positive and negative controls together with samples were used in a MTC410 apparatus for amplification. FD-12 apparatus was used to evaluate the results. In addition, electrophoresis on agarose was used for confirmation of the results.<br> <strong>Findings</strong><strong><em>:</em></strong> From 56 sputum samples of suspected TB patients, 20 samples were positive and 36 samples were negative on microscopic evaluation and culture methods. FLASH-PCR molecular analysis showed that all of 20 positive samples were positive in molecular methods, too. On the other hand, three of sputum samples that were negative by culture and staining were positive in FLASH-PCR method. One of these 3 patients, received Isoniazid, pyrazinamide and ethambutol antibiotic by responsible medicine. All results were confirmed using conventional electrophoresis.<br> <strong>Conclusion:</strong> In some negative samples, possibly because of the small number of bacteria in sample or a defect in the sampling, the Flash PCR may due good advantages. Therefore, due to the low cost, this method is recommended for routine use.</span></span></div> بیماری سل, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, تشخیص, روش Flash PCR, روش کشت Tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis, Detection, Flash PCR, Culture method 77 85 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1096-6&slc_lang=fa&sid=1 Ali Reza Morad Abadi علیرضا مرادآبادی 4600319475328460063800 4600319475328460063800 No Department of Hematology, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran. گروه هماتولوژی، دانشگاه علوم پزشکی کرمان، کرمان، ایران. Mohammad Arjomandzadegan محمد ارجمندزادگان arjomandzadegan@arakmu.ac.ir 4600319475328460063801 4600319475328460063801 Yes Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Medicine, Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. گروه میکوبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Navid Emami نوید امامی 4600319475328460063802 4600319475328460063802 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Manijeh Kahbazi منیژه کهبازی 4600319475328460063803 4600319475328460063803 No Department of Pediatrics, Faculty of Medicine, Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. گروه اطفال، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، ،دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Azam Ahmadi اعظم احمدی 4600319475328460063804 4600319475328460063804 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Saeed Falahat سعید فلاحت 4600319475328460063805 4600319475328460063805 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Seyyed Hossein Hosseini سید حسین حسینی 4600319475328460063806 4600319475328460063806 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Mehdi Kargaran مهدی کارگران 4600319475328460063807 4600319475328460063807 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران. Parisa Khosravi پریسا خسروی 4600319475328460063808 4600319475328460063808 No Infectious Diseases Research Center (IDRC), Arak University of Medical Sciences, Arak, Iran. مرکز تحقیقات ‌بیماری‌های عفونی (IDRC)، دانشگاه علوم پزشکی اراک، اراک، ایران.