Journal of Arak University of Medical Sciences

fa جداسازی و شناسایی اکتینوباکترهای کمیاب از آب‌های خلیج فارس و دریای عمان Isolation and Identification Rare Actinobacteria from Persian Gulf and Oman Sea عفونی Infection پژوهشي اصیل Original Atricle <div style="text-align: justify;">زمینه و هدف: استفاده گسترده از آنتی بیوتیک‌ها منجر به افزایش باکتری‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک و نرخ بالای مرگ‌ومیر در اثر بیماری‌های عفونی شده است. Pseudomonas aeruginosa یکی از مهم‌ترین عوامل ایجادکننده عفونت‌های بیمارستانی است که به طیف وسیعی از آنتی بیوتیک‌ها مقاوم است. بنابراین یافتن منبع جدید ترکیبات ضدمیکروبی برای غلبه بر بیماری‌های عفونی مقاوم به آنتی بیوتیک کاملاً حیاتی است. غربال‌گری اکتینوباکترهای بومی راهکاری موثر به منظور یافتن ترکیبات ضدمیکروبی جدید است. هدف پژوهش حاضر جداسازی، غربالگری و شناسایی اکتینوباکترهای نادر و بومی ایران به منظور یافتن سویه‌های اکتینوباکتر مولد ترکیبات ضدمیکروبی علیه P. aeruginosa است. مواد و روش‌ها: 30 نمونه آب و رسوب از خلیج‌فارس و دریای‌عمان جمع‌آوری و برای جداسازی اکتینوباکترها در محیط مناسب کشت شد. جدایه‌های اکتینوباکتر تخلیص شدند و پس از استخراج متابولیت‌ها، فعالیت ‌آن‌ها بر علیهP. aeruginosa ‌ بررسی شد. حداقل غلظت مهارکننده رشد (MIC) عصاره برتر با روش میکرودایلوشن براث تعیین و در نهایت سویه برتر شناسایی شد. ملاحظات اخلاقی: در مطالعه حاضر، تمامی اصول ایمنی زیستی و اخلاق زیستی رعایت شده است. یافته‌ها: 50 اکتینوباکتر از رسوبات مورد بررسی جداسازی شدند. نتایج نشان داد که 5 جدایه دارای فعالیت ضدمیکروبی قابل‌توجهی هستند. MIC عصاره برتر علیه P. aeruginosa، 100 میکروگرم در میلی‌لیتر بود. آنالیز مولکولی ژن SrRNA16 نشان داد که جدایه دارای موثرترین عصاره متعلق به جنس Micromonospora بوده و 8/99 درصد شباهت بهM. chalcea  دارد. نتیجه‌گیری: این پژوهش نشان داد که آب‌های جنوب ایران و رسوبات موجود در ‌آن‌ها منابع نویدبخشی از اکتینوباکترهای نادر توانمند در تولید ترکیبات میکروبی علیه P. aeruginosa می‌باشند. </div> <table align="center" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:101.86%;" width="101%"> <tbody> <tr> <td style="width: 64.16%; height: 85px; text-align: justify;">Background and Aim: The widespread use of antibiotics has been led to increased emergence of antibiotic resistant bacteria and high mortality and morbidity rates due to infectious diseases. Pseudomonas aeruginosa is one of the most important causes of nosocomial infections, which shows high resistance to a wide range of antibiotics. So, finding new and effective antimicrobial compounds in order to overcome antibiotic resistant infectious diseases is so critical. Screening of native actinobacteria can be an effective strategy to find novel antimicrobial compounds. The aim of current study was isolation, screening and identification of rare actinobacteria to find the strains which produce antimicrobial compounds against P. aeruginosa. Material and Methods: Thirty samples of water and sediments were collected from Persian Gulf and Oman Sea and used for isolation of actinobacterial strains. After isolation of actinobacteria, their metabolites were extracted and their anti-P. aeruginosa activities were investigated. Minimum inhibitory concentration (MIC) of the most efficient extract was determined using broth microdilution method. Finally, the most efficient strain was identified. Ethical Considerations: In this study, all principles of biosafety and bioethics have been considered. Findngs: Fifty actinobacteria were isolated from water and sediments. Five isolates had considerable antimicrobial activity. MIC value of the most efficient extract against P. aeruginosa was 100 µg/ml. Molecular analysis of 16SrRNA showed that the most effective fermentation broth extract belongs to Micromonospora and has 99.8% similarity to M. chalcea. Conclusion: The current study revealed that the water of southern Iran and their sediments are promising sources of potent rare Actinobacteria in the production of antimicrobial compounds against P. aeruginosa.</td> </tr> </tbody> </table> <div style="text-align: justify;"><div style="clear:both;"></div></div> اکتینوباکترها , مقاومت آنتی بیوتیکی, Pseudomonas aeruginosa Actinobacteria, Antibiotic resistance, Pseudomonas aeruginosa 28 38 http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4973-1&slc_lang=fa&sid=1 Behnoush Sadat Khalili بهنوش سادات خلیلی Asri1992.behnoush@gmail.com 4600319475328460065949 4600319475328460065949 No Department of Microbiology, Faculty of Advanced Sciences and Technologies, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فن‌آوری‌های نوین، واحد علوم دارویی، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران. Javad Hamedi جواد حامدی jhamedi@ut.ac.ir 4600319475328460065950 4600319475328460065950 Yes Department of Microbial Biotechnology, School of Biology and Center of Excellence in Phylogeny of Living Organisms, College of Science, University of Tehran, Tehran, Iran. Microbial Technology and Products Research Center, University of Tehran, Tehran, Iran. دانشگاه تهران Setareh Haghighat ستاره حقیقت Setareh_haghighat@yahoo.com 4600319475328460065951 4600319475328460065951 No Department of Microbiology, Faculty of Advanced Sciences and Technologies, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran. گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فن‌آوری‌های نوین، واحد علوم دارویی، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.