<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Arak University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشكي اراك</title_fa>
<short_title>J Arak Uni Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jams.arakmu.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>46</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>journal46</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-5338</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-644X</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/jams</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2016</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>19</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>کلونینگ، بیان و تخلیص پروتئین نوترکیب فیوژن Tat-Nef ویروس HIV-1 در سیستم بیانی پروکاریوتی</title_fa>
	<title>Cloning, Expression and Purification of the Recombinant HIV-1 Tat-Nef Fusion Protein in Prokaryotic Expression System</title>
	<subject_fa>عمومى</subject_fa>
	<subject>General</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Atricle</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right: 28.9pt; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و هدف:&lt;/strong&gt; یکی از پروتئین&#8204;های مهم ویروس &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;HIV-1&lt;/span&gt; به نام &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nef&lt;/span&gt; نقش مهمی در چرخه تکثیر ویروس و پیشرفت بیماری ایدز دارد و القای پاسخ ایمنی بر ضد آن می&#8204;تواند تا حدی عفونت ویروسی را مهار نماید. به علاوه، بخشی از ناحیه پروتئین فعال کننده رونویسی (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat&lt;/span&gt;، اسید آمینه&#8204;های 48 تا 60) از ویروس &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;HIV&lt;/span&gt; توانسته است به عنوان یک پپتید نفوذ کننده سلولی (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;CPP&lt;/span&gt;) عمل نماید. در این تحقیق، برای اولین بار کلونینگ و بیان فیوژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat-Nef&lt;/span&gt; در باکتری اشرشیاکلی صورت گرفت. تأیید بیان پروتئین توسط آنالیز وسترن بلات و تخلیص آن از طریق روش رنگ آمیزی معکوس انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right: 28.9pt; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;مواد و روش&lt;/strong&gt;&#8204;&lt;strong&gt;ها:&lt;/strong&gt; در این مطالعه تجربی، ابتدا کلونینگ فیوژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat-Nef&lt;/span&gt; در وکتور بیانی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pGEX6p2&lt;/span&gt; صورت گرفت. سپس القای بیان پروتئین نوترکیب &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat-Nef&lt;/span&gt; در باکتری اشرشیا کلی سویه &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;BL21 (DE3)&lt;/span&gt; توسط القا کننده &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;IPTG&lt;/span&gt; انجام شد. تأیید بیان از طریق تکنیک &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SDS-PAGE&lt;/span&gt; و وسترن بلات با استفاده از آنتی&#8204;بادی منوکلونال ضد &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nef&lt;/span&gt; صورت گرفت. سپس، تخلیص پروتئین فیوژن توسط تکنیک رنگ آمیزی معکوس از روی ژل انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;margin-right: 28.9pt; text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&lt;/strong&gt;&#8204;&lt;strong&gt;ها:&lt;/strong&gt; نتایج آنالیز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; و هضم آنزیمی، وجود باند واضح حدود 726 جفت باز را روی ژل آگارز تأیید کرد که نشان&#8204;گر کلونینگ صحیح فیوژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat-Nef&lt;/span&gt; در وکتور بیان پروکاریوتی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;pGEX6p2&lt;/span&gt; بود. هم&#8204;چنین، وجود باند پروتئینی حدود 54 کیلودالتون روی ژل &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SDS-PAGE&lt;/span&gt; نشان&#8204;گر بیان پروتئین &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Tat-Nef&lt;/span&gt; بود که توسط آنتی&#8204;بادی منوکلونال ضد &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Nef&lt;/span&gt; در آنالیز وسترن بلات تأیید شد.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify; margin-right: 40px;&quot;&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;نتیجه&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;گیری:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; پروتئین فیوژن نوترکیبTat-Nef &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;تخلیص شده به عنوان یک آنتی ژن برای طراحی واکسن پروتئینی در مقابل&amp;nbsp; &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;عفونت ویروس&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt; HIV استفاده خواهد شد.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; Nef is one of the HIV-1 critical proteins, because it is essential for viral replication and AIDS disease progression and induction of immune response against it can partially inhibit viral infection. Moreover, a domain of the HIV-1 Trans-Activator of Transcription (Tat, 48-60 aa) could act as a cell penetrating peptide (CPP). In current study, cloning and expression of Tat-Nef fusion protein was performed in &lt;em&gt;E.&lt;/em&gt; &lt;em&gt;coli&lt;/em&gt; for the first time. The protein expression was confirmed by western blot analysis and was purified using reverse staining method.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Materials and Methods:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In this experimental study, primarily, cloning of Tat-Nef fusion gene was done in pGEX6p2 expression vector. Then, the expression of Tat-Nef recombinat protein in &lt;em&gt;E.coli&lt;/em&gt; BL21 (DE3) strain was performed by using IPTG inducer. The protein expression was confirmed by SDS-PAGE and western blotting using anti-Nef monoclonal antibody. Then, the recombinant fusion protein was purified from gel using reverse staining method.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The results of PCR analysis and enzyme digestion showed a clear band of ~ 726 bp in agarose gel indicating the correct Tat-Nef fusion cloning in pGEX6p2 prokaryotic expression vector. In addition, a 54 kDa band of Tat-Nef on SDS-PAGE revealed Tat-Nef protein expression that western blot analysis using anti-Nef monoclonal antibody confirmed it.&lt;/p&gt;

&lt;p style=&quot;text-align: justify&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The purified Tat-Nef recombinant fusion protein will be used as an antigen for protein vaccine design against HIV infection.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>ویروس HIV, Nef, Tat, پروتئین نوترکیب, باکتری اشرشیاکلی, واکسن  </keyword_fa>
	<keyword>HIV virus, Nef, Tat, Recombinant protein, E. coli, Vaccine</keyword>
	<start_page>60</start_page>
	<end_page>68</end_page>
	<web_url>http://jams.arakmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4144-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Somayeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Kadkhodayan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کدخدایان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>4600319475328460064016</code>
	<orcid>4600319475328460064016</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Sciences and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Shiva</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Irani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>شیوا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایرانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>4600319475328460064017</code>
	<orcid>4600319475328460064017</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyed Mehdi </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sadat</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سادات</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>4600319475328460064018</code>
	<orcid>4600319475328460064018</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Hepatitis and AIDS, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش هپاتیت و ایدز، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Fatemeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fotouhi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فتوحی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>4600319475328460064019</code>
	<orcid>4600319475328460064019</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Influenza Research Lab., Department of Virology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>آزمایشگاه تحقیقاتی آنفلوانزا، بخش ویروس شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Azam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bolhassani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اعظم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بوالحسنی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>A_bolhasani@pasteur.ac.ir</email>
	<code>4600319475328460064020</code>
	<orcid>4600319475328460064020</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Hepatitis and AIDS, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش هپاتیت و ایدز، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
